Линкълн Бъроуз е осъден на смърт заради убийство на брата на вицепрезидента. Той настоява, че е невинен, но никой освен неговия брат Майкъл Скофийлд, не му вярва. Като инжинер, чиято фирма е наета да възстанови затвора, където Линкълн е държан, майкъл предприема драстични мерки, за да му помогне. Той ограбва банка и е изпратен в същия затвор, така че чрез своите знания за сградата, че двамата могат да избягат заедно.
Скоро обаче, планът на Майлъл става по-сложен отколкото той е мислил, защото някои от затворниците, разбират за него и искат също да се включат в бягството.
Освен това, Майкъл разбира за масивен правителствен заговор, целящ екзекуцията на брат му Линкълн, когато двама федерални агенти опитват да убият бившата съпруга на Бъроуз и сина му. Бягството се оказва почти невъзможно, но Майкъл е решен на всичко, за да измъкне Линкълн и себе си…
